Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Best2Q8BGM5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms