Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx32Q80ZJ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx32Q80ZJ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms