Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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