Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Negr1Q80Z24 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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