Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrfn4Q80XU8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrfn4Q80XU8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrfn4Q80XU8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms