Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnma8aQ80VM8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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