Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms