Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms