Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp3Q7TST5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms