Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnf1Q7TSH7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnf1Q7TSH7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms