Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdp1Q7TSG2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdp1Q7TSG2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms