Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms