Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdcl2Q78Y63 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms