Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot1Q6ZQ08 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms