Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RimklaQ6PFX8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RimklaQ6PFX8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms