Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrm2bQ6PEE3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms