Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd4aQ6PDC8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd4aQ6PDC8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms