Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim37Q6PCX9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim37Q6PCX9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim37Q6PCX9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms