Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RgmaQ6PCX7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms