Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2d40Q6P8N9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms