Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2mQ6P6I6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2mQ6P6I6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms