Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Hecw2Q6I6G8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms