Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rftn1Q6A0D4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rftn1Q6A0D4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms