Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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