Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CltcQ68FD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CltcQ68FD5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms