Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms