Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
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Ccdc18Q640L5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc18Q640L5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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Ccdc18Q640L5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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