Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga3Q62470 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms