Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms