Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssr4Q62186 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms