Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sema3cQ62181 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms