Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema3bQ62177 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3bQ62177 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms