Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd2Q61285 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd2Q61285 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms