Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc6Q61143 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms