Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms