Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp13a3Q5XF89 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp13a3Q5XF89 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms