Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms