Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc11Q5U458 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms