Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms