Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms