Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trdv4Q5R1A3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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