Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trappc1Q5NCF2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trappc1Q5NCF2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Trappc1Q5NCF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc1Q5NCF2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms