Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms