Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf2Q4ZGD8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf2Q4ZGD8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms