Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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