Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thsd4Q3UTY6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms