Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms