Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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