Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cep63Q3UPP8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms