Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem253Q3UNB8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem253Q3UNB8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem253Q3UNB8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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